尖锐湿疣常用的实验室检查有：
  (1)细胞学宫颈涂片检查是一种常用于检测无症状宫颈人乳头瘤病毒感染的方法，但不敏感。
    (2)5％醋酸白试验。是在可疑皮损上用5％醋酸溶液涂抹或敷贴3～5分钟，有尖锐湿疣的皮肤局部发白为阳性，其机制尚不清楚，可能是受HPV感染的上皮细胞的角蛋白容易被醋酸溶液所凝固的结果。醋酸白试验对诊断与指导治疗尖锐湿疣有很大价值，但也有假阳性，在尿道炎、包皮龟头炎、外阴念珠菌病、EB病毒感染等中可出现假阳性。所以要结合临床表现和其他检查结果综合分析。
    (3)组织病理检查。是把尖锐湿疣取下来，制片，在显微镜下可以看到其角质层角化过度伴有角化不全，棘层肥厚，钉突延长，假性上皮瘤样增生，在角质层、颗粒层和棘细胞层上部有凹空细胞，凹空细胞是HPV感染后的一种变性细胞，具有诊断价值。此外，表皮内有核分裂相，多核细胞和角化不良细胞，真皮水肿，毛细血管扩张，周围有慢性炎症细胞浸润，主要是淋巴细胞和组织细胞。从实用角度来讲，组织病理检查是最切实可行的方法，是主要的确诊手段。
    (4)分子生物学方法。聚合酶链反应(PCR)是目前常用的检测人类乳头瘤病毒DNA的方法之一，此方法敏感性特异性强，当100万个细胞中存在1个HPV DNA就能检测出，可弥补组织学诊断上的不足，尤其适用于可疑病例的确诊。但．PCR技术也存在不足之处，如有极微量微生物DNA污染试剂或实验用品时，就有可能会出现假阳性结果。其次，用PCR方法检测HPV基因，不能区分活跃程度，在判愈方面有相当的局限性。因此，在使用PCR技术时，不仅需要规范的实验室、先进的仪器设备、高水平的技术人员，还需要综合临床情况、取长补短、互相印证。
    (5)免疫组织化学检测。用带有过氧化物酶的抗体检查HPV抗原，病变组织切片染色经一系列处理后，发现表皮有空泡化细胞，核内有棕褐色颗粒状沉着为阳性，阳性率在40％～60％。此方法一般用于研究，不作常规诊断使用。